Autori: Francesca Becherucci (1), Samuela Landini (2), Benedetta Mazzinghi (1), Marco Allinovi (2), Fiammetta Ravaglia (1), Sabrina Giglio (1,2), Paola Romagnani (1,2)
Affiliazioni: (1) SOC Nefrologia e dialisi, Ospedale pediatrico Meyer, Firenze; (2) Dipartimento di Scienze Biomediche, Sperimentali e Cliniche “Mario Serio”, Università degli Studi di Firenze; (3) SOC Genetica Medica, Ospedale pediatrico Meyer, Firenze
La sindrome nefrosica idiopatica pediatrica è un’entità clinica con la quale si presentano diverse patologie renali, caratterizzate da risposta variabile alla terapia immunosoppressiva e da prognosi eterogenea. Abbiamo ipotizzato che il sequenziamento genico whole-exome sequencing (WES) possa migliorare la diagnosi e la definizione dell’outcome dei pazienti.
Abbiamo combinato l’analisi approfondita del fenotipo clinico con il sequenziamento WES seguito dal filtraggio bioinformatico di un pannello di 277 geni responsabili di nefropatie ereditarie in una coorte di 109 pazienti affetti da sindrome nefrosica steroido-resistente (SRNS, 62 pazienti) o steroido-sensibile (SSNS, 47 pazienti). L’analisi della segregazione delle varianti nella famiglia ha consentito di distinguere le varianti potenzialmente patogenetiche (PPV) da quelle di significato clinico incerto (VUS).
Abbiamo identificato una causa genetica nel 61.3% dei pazienti affetti da SRNS. Le PPV interessavano geni podocitari nel 29% dei casi, geni della membrana basale glomerulare nell’11.3% dei casi e geni responsabili di anomalie congenite del rene e delle vie urinarie, ciliopatie e malattie tubulari nel 21% dei casi, spesso in combinazione con creazione di genotipi complessi e unici. Il 14.5% dei pazienti con SRNS presentava VUS e solamente il 24.2% era completamente negativo. Al contrario, il 100% dei pazienti con SSNS non presentava PPV. L’analisi multivariata ha identificato il test genetico come l’unica variabile predittiva dell’outcome nei pazienti affetti da SRNS.
L’analisi con WES in pazienti affetti da SRNS incrementa significativamente la diagnosi genetica ed è in grado di predire la prognosi e guidare le scelte terapeutiche, consentendo la personalizzazione della gestione clinica complessiva del paziente.